A26216 Ion 16S™ Metagenomics Kit
Набор Ion 16S™ Metagenomics Kit предназначен для быстрого, комплексного и широкого спектра анализов смешанных микробных популяций с использованием рабочего процесса полупроводникового секвенирования Ion Torrent™. Набор позволяет проводить ПЦР-амплификацию гипервариабельных областей гена 16S рДНК бактерий. Затем амплифицированные фрагменты можно секвенировать с помощью набора Ion PGM™ Sequencing 400 Kit на платформе Ion PGM™ и анализировать с помощью модуля метагеномного анализа Ion 16S™ в программном обеспечении Ion Reporter™.
Применим в различных анализах
Набор включает 2 набора праймеров, которые можно использовать для амплификации соответствующих гипервариабельных участков гена 16S рДНК у бактерий:
• Комплект грунтовки V2-4-8
• Комплект грунтовки В3-6,7-9
Эти комплексные наборы праймеров позволяют точно обнаруживать и идентифицировать широкий спектр бактерий вплоть до уровня рода или вида. Наборы праймеров сочетаются с Environment Master Mix v2.0, оптимизированным для устойчивости к высоким уровням ингибиторов ПЦР и амплификации мишеней из сложных образцов, таких как образцы из окружающей среды, продуктов питания, тканей и других сложных образцов. Кроме того, в комплект входит положительный контроль для экспериментов по устранению неполадок.
Гибкий
Наборы праймеров представлены в виде двух пулов. Каждый пул можно использовать по отдельности или в комбинации, чтобы обеспечить гибкость экспериментальной установки. В сочетании с наборами адаптеров штрих-кода Ion Xpress™ несколько полимикробных образцов могут быть объединены в одном рабочем процессе секвенирования.
Полный рабочий процесс
Последовательности, созданные с помощью набора Ion 16S™ Metagenomics Kit, могут быть непосредственно проанализированы с помощью модуля анализа метагеномики Ion 16S™ в программном обеспечении Ion Reporter™, что позволяет проводить быструю полуколичественную оценку сложных микробных образцов.
Примечание. Этот набор несовместим с набором для количественного анализа библиотеки ионов (кат. № 4468802). Для точного количественного определения ампликонов, полученных с помощью этого набора, используйте набор для количественного анализа Ion Universal Library (кат. № A26217).
Содержание и хранение
• Буфер для разведения ДНК (7 мл)
• 2 пробирки с 2-кратным раствором мастер-микса для окружающей среды (0,8 мл на пробирку)
Хранить вышеуказанное при температуре 2-8°C.
• Контроль ДНК E. coli (40 мкл)
• Вода отрицательного контроля (1 мл)
• Набор праймеров 16S V2-4-8 (300 мкл)
• Набор праймеров 16S V3-6,7-9 (300 мкл)
Хранить при температуре от -5 до -30°C.